降身于夜晚，引得警察手忙脚乱，背着翅膀，这不是怪盗基德，这是怪盗Dark（置鲇龙太郎 配音）。沉睡了40年的Dark在高中生丹羽大助（入野自由 配音）14岁生日当天借由大助暗恋的女生原田梨纱（浅野真澄 配音）的照片苏醒。这在丹羽家是世代守护的秘密。于是，平凡的大助有了二重身份，晚上是窃取艺术品的怪盗，白天是高中生，而Dark的灵魂则寄居在大助的体内。
身手灵敏的大助引起了同班同学日渡怜（石田彰 配音）的注意和怀疑，总是时不时的找大助麻烦。而大助暗恋的梨纱却对Dark一见钟情。梨纱的双胞胎姐姐梨红（中山真奈美 配音）却因为一次意外引起了Dark的注意，进而引起了大助的好感。扑朔迷离的感情走向和危险的临近逐渐把故事推向高潮……
舞台は西暦2087年。月に誕生した軍事政権による統一国家ギガノス帝国が地球連合に対して一方的に独立を宣言し、宣戦を布告。戦火はスペースコロニーと地球本土に拡大し、月面のマスドライバーやメタルアーマー (MA) などの兵器によって、地上の7割はギガノスに占拠されていた。
そんな中、スペースコロニー「アルカード」の住人である主人公ケーンワカバ、タップオセアノ、ライトニューマンの3人は、ひょんなことから新開発メタルアーマーD兵器（ドラグナー）のパイロットとして登録されてしまい、追撃部隊を撃破する。こうして、彼らはギガノス帝国の追撃艦隊と戦いながら地球連合軍本部を目指すことになる。
生まれも育ちも東京葛飾柴又。毎度フーテンを決め込む寅さんは、怪獣と戦う夢など見つつ気ままな一人旅。旅の途中、夜汽車の中で出会った流しの歌手「リリー」の身の上話についホロリ。そして到着したのは北海道網走のとある牧場。いじめられっ子の進一にミョーなケンカの仕方を教えてあげたりと楽しい日々。でも牧場の仕事は重労働、ついに倒れて柴又へ。そんなある日、あのリリーが寅さんを訪ねてやってきたからもうびっくり…！！
