《校园三剑客》是根据著名少年科幻作家杨鹏的同名畅销作品改编而成的系列动画片。该动画片通过“小孩救大世界”的模式，讲述了超强超酷的少年组合“校园三剑客”(“灵异少年”杨歌，“聪慧美眉”白雪和“电脑天才”张小开)对发生在校园及世界各地的神秘事件进行探险的科幻侦探故事。整部片子充满了孩子们喜闻乐见的科幻想象力，风格清新、幽默、神奇、惊险，人物形象富于时尚感，倡导一种中国孩子久违了的英雄主义和冒险精神。 本片将采用2D结合3D的技术进行制作，计划用3-5年时间制作1000集以上，每集22分钟。第一部的26集在2008年9月制作完成，将选择在中央电视台和各省市电视台播出，并开发9大类相关的衍生产品。
带着暑假旅行的好笑、有趣回忆，同学们开始了大三生活，班主任丰翠翠直接给他们来了个下马威——因为他们是摄影专业的缘故，大四都开始实习、工作，这就意味着大三是他们在学校待的最后一年，而很多人直到现在对自己的未来仍然十分迷茫。开完班会后，大家虽然嘴上不说，心里却都有各自的想法，这注定是一个不同寻常的大三。随后的班干部改选、校园招新，学生会主席竞选、出镜记者作业、一分钟视频大赛等笑点不断，各出奇招，结果出人意外。丰翠翠特意调课为班级争取两周时间拍摄实习作品，众人在布村有着出乎意料的际遇，收获了不一样的感动。之后，众人参加了最后一次校园冬季救助会，在欢笑中结束了校园生活。班主任的苦心没有白费，学生们都开始尝试将自己的爱好和专业结合起来，分别朝着自己的方向前进。
福娃之一的贝贝在梦中遇到激战的“和平女神雅典娜”与“战神阿瑞斯”。
战败的雅典娜身受重伤，她告诉贝贝：在时空隧道中的1896年，有一个隐藏了巨大能量的木盒，只有得到里面的能量，才能恢复自己的盾牌和生命，打败邪恶的阿瑞斯。
醒来之后，在顾拜旦来信的提示下，贝贝立下誓言：要穿越时空，回到1896年，帮助女神取得木盒。
依照雅典娜的指示：贝贝下海寻找能够穿越时空的东方时空老人“必喜”。但却在深海峡谷中，遇到了贪吃成性的小妖怪——皮休。他是龙之九子，必喜的弟弟。多年前因为想吃太阳而掉入大海，目前正为自己“永远饥饿”的胃病而苦恼，一听说隐藏巨大能量的木盒，也十分积极地加入了贝贝的旅行。
在皮休的带领下，贝贝找到了必喜。必喜载着二人进入了“时空隧道”，却在通过了二十一世纪大门之后不久，中了阿瑞斯手下普噜噜的埋伏，必喜双眼失明，被迫停止旅行。
必喜要孩子们进入最近...
