《神医华佗》是一部大投资、大制作的大型剧集，为了把一代神医华佗青年时代传奇浪漫故事表现得更动人，特聘请了台湾亚视的首席导演李翰韬和蒲腾晋执导，又精心挑选以脍炙人口的《苍天有泪》的男女主人公扮演者庹宗华、蒋勤勤来完成《神医华佗》男女主人公的形象塑造。
这部耗资千万元巨资投拍的大型电视连续剧，故事情节超凡脱俗，曲折跌宕，既有悲壮的历史演绎，又不乏缠绵的爱情纠葛，更有爱国。护国、增加民族团结的正义悲歌。该剧阵容强大、气势恢宏。制作精美、港台大陆影星云集。清秀冷峻的庹宗华，将一代神医华佗极具传奇色彩的青年时代演得更为可亲可爱可敬，又甜又水灵的蒋勤勤把一个九五之尊的高贵公主演得令人瞠目仰视。而她同时又把这位公主为爱情和医学献身屈驾出宫，甘同华佗颠沛流离后的吃苦耐劳。平易近人，娇美可人演得更加令人疼爱有加。两位红星通过这次形象塑造使他们的演技和知名度再度深入人们...
王瑞龍(楊慶煌飾)是迪化街「金合益」綢緞莊的老闆，專營綢緞、布匹大批發。其實瑞龍原是孤兒，十歲時為「金合益」老頭家郭查某收留，十幾年時光，從學徒、夥計升為二掌櫃。他的忠厚、篤實身受查某賞識，查某無子，臨死前動之以情，招為女婿繼承家業。
瑞龍國小學歷，金珠(林秀玲飾)高商畢業，金珠根本看不起瑞龍。繫於利害的婚姻，夫妻感情淡薄。金珠在家驕縱跋扈，瑞龍毫無尊嚴可言。為平衡內心鬱卒，常 到台北橋頭看落日，邂逅了也愛看落日的美鳳(狄鶯飾)；話說美鳳是歌仔戲班的小旦，由於戲班生存困難，美鳳被班主養父母安排賣至酒家陪酒，美鳳不願，出奔 流落台北橋頭，本想投水自殺，巧遇瑞龍道出原委，瑞龍乃出鉅資，為美鳳贖身；美鳳感恩戴德，矢志報答瑞龍，瑞龍於是在細姨巷為美鳳買了棟房屋居住。
郭金珠勢利、多疑，林美鳳溫婉、貼心，瑞龍重林輕郭，乃屬必然。瑞龍深愛美鳳，並屬意美鳳為他生子...
重案组刑警吴英雄（赵又廷 饰）在拯救客机后成为警界明星，出演各种警队宣传片风光无两。是日，海港城陷入突然危机，高铁、跨海大桥等交通要道突发连环爆炸，吴英雄在追索嫌凶过程中与东区分局刑事侦查组刑警陈真（林更新 饰）结为搭档，又再度重逢被逼做人肉炸弹的通缉犯徐达夫（黄渤 饰）。原来，一号为“夜行者”的神秘组织绑架了徐达夫等通缉犯的家属，逼迫他们作为人肉炸弹将海港城通向外界的各通路炸毁，使海港城变为孤城，以释放生化病毒，执行毁灭城市的“枯草计划”。吴英雄和陈真为解救徐达夫妻子杜小晴（关颖 饰）并阻止枯草计划，与鉴识官蓝西英（张钧甯 饰）、黑鹰队成员黄世楷（修杰楷 饰）等人向夜行者发起挑战。
