与妈妈相依为命生活在人类城市天台的小老鼠舒 克喜欢研究飞机，在第一次跟妈妈获取食物的过 程中被鸽子指责是个不劳而获的小偷，舒克不喜 欢被人误解成小偷，他决心成为飞行员来向其他 人证明，老鼠也可以靠劳动获得尊重;
但他刚一离开家，就因为老鼠的身份被误会成了 小偷，在查询真相自证清白的过程中，认识了坦 克手贝塔;
贝塔也是一只小老鼠，他无父无母，从小被猫咪 咪丽欺负，无意得到坦克车后，因不愿和咪丽一 样欺负弱者而选择离开;
舒克贝塔不打不相识，成为了挚友，两人决定建 一个飞机场来帮助森林的小动物出行;
在外出为机场寻找电池的路上，迫降到一个老鼠 国王统治的猫的王国——克里斯王国，在这里他们将会经历怎样的奇遇呢......
皮皮鲁抢走了缩小芯片，带舒克贝塔回家。为躲避捕鼠队，三人从皮皮鲁家逃至交易市场。捕鼠队继续追击到这里。朋友加西和琪琪等布置了防御措施，与强大的机械狗、无人机对抗，老鼠科学家也来抢夺芯片。
危急关头，皮皮鲁选择缩小加西、方猎猎等，大家共同商议如何对付白客公司。同时，白客公司开始转移实验室。舒克贝塔琪琪等开着飞机坦克和摩托车与白客公司交战，夺回了实验室。但恢复芯片却落入白客手中。皮皮鲁改造升级了装备帮助大家潜入。
舒克贝塔终于找到恢复芯片，却不幸被捕鼠队长抓住，在监狱见到了旧敌白路。原来他因放电功能被抓来 做实验。在白路的帮助下，舒克等人得以逃脱。没想到科学家潜入白客公司，控制了老板，大战一触即发。
