动画第2季《Fate/kaleid liner》（魔法少女伊莉雅2wei）将是漫画版《Fate/kaleid liner魔法少女伊莉雅2wei》的内容，紧接第一季，继续讲述自回收卡片作战过后数周以来，伊莉雅重返过去的日常生活。然而，既然已经当过魔法少女，麻烦就会如影随形！这次她竟然是被无预警出现的另一个自己追杀!魔法恐怖(？)故事。第2幕堂堂开演！
时值2007年的秋天，北原春希（水岛大宙 配音）是一位就读于峰城大学附属学园的平凡高中三年级学生，为了替自己的高中生活划下完美的句号，春希加入了轻音乐同好社团。可是，惨淡的经营让这个本就默默无闻的社团几近崩溃，春希的美好愿望眼看着就要破灭。
一次偶然中，正在独自弹奏吉他的春希突然听到一段美妙的歌声，追寻着这声音，一个名叫小木曽雪菜（米泽円 配音）的女生出现在了春希的面前。雪菜是学校里的偶像人物，之后，雪菜经由春希的邀请加入了轻音部。紧接着加入的是能够弹奏一手好钢琴的女生冬马和纱（生天目仁美 配音），和纱的叛逆和不羁人尽皆知，可即便如此，春希还是热忱地邀请了和纱“入伙”。
故事发生在罗森博格骑士养成学校中，这所历史悠久的学校凭借着培养可以保家卫国的优秀骑士而闻名遐迩。作为刚入校的新生，哈维亚（柿原彻也 配音）对未来的学习生活充满了期待和憧憬，没想到这样的期待维持了没多久，他就因为打败了个性好强而又高傲的同学普莉希亚（榊原由依 配音）而交上了厄运。好在普莉希亚虽然脾气暴躁但本性善良，她的存在为哈维亚平静的生活增添了一丝乐趣。
个性温和沉默寡言的神乐（生天目仁美 配音）、个性活泼好斗的菲尔（水桥香织 配音）、温柔体贴的菲莉雅（桃井晴子 配音）、状况频出的布莉婕特（阿澄佳奈 配音），随着时间的流逝，可爱的女孩子们接连出现在哈维亚的身边，而她们的历史中，竟然隐藏了一个悲哀而又残酷的故事。
时间要追溯到一千八百多年前，与我们所熟知的实际的中国历史不同的、另一个时空下的幻想古代中国（扯）。那里，是很多英雄争夺霸权的战乱世界。与这样纷争的时代相抗衡的，有一个被成为“深红的武士”的义贼在孤独的战斗着。他的名字叫做陆逊伯言。与老师诸葛孔明一起周游列国的他深深的在为这个悲凉的世界而担忧着……
某日，陆逊与孔明一起卷入到了江东小霸王孙策率领的吴军和大陆最大势力的魏军的战斗中。对於弱小的吴军而言，魏军拥有压倒性的兵力，谁都不会怀疑魏军会在战争中取胜。然而，为了取得战争的胜利，孙策使用被封印的“力”。在凶猛同时不祥的“力”的波动下，陆逊被封印起来的记忆觉醒了！那是因为孙策力量的来源正是陆家代代相传的“玉玺”，他杀掉了陆逊的父亲强行将“玉玺”掠夺到手。
一切纷争的元凶就是“玉玺”！而那个“玉玺”正是陆家代代相传并保护着的东西！面对踌躇的陆逊，孔明说出了令...
莜玛（斋藤桃子 配音）是生活在魔界的公主，个性大大咧咧乐观向上，对即将到来的每一天都充满着希望，开朗的一点都不像魔族。帕克拉（平野绫 配音）是一名吸血鬼，个性非常强势的她在喜欢的男人面前就会来个一百八十度的大转弯，变成唯唯诺诺十分乖顺的“小猫咪”。
莉露（生天目仁美 配音）是一名狼人少女，性格热情奔放，对肉类有着狂热的爱好，自控能力尚且不足的她，在看到和月亮有些相似的黄颜色圆形物体时就会变身。铁子（明坂聪美 配音）外表看似可爱的少女，实际上却是由钢铁打造的人造人。这四位特殊的女性来到人间界，在这里展开了修炼。
第1巻：メイドロボ「イルファ」のロケテストが向坂家で行われることに。 最新カメラを構え、願望叶って臨戦体勢の雄二。 しかし、そこには巨大な“越えられない壁”が…！？
第2巻：貴明はクラスメートや環、このみたちと、海水浴へ行くことに。愛佳から一緒に行こうと誘われた妹郁乃は、「姉貴の保護者」を宣言して参加する。愛佳の夏の日の恋とドタバタの行方は？
第3巻：翌日に控える学園祭、生徒会長ささらの準備のおかげで無事開催されるはずが、前会長まーりゃんの陰謀によってどんどん崩れていく。果たしてまーりゃんの計画とは？ ささらと貴明はそれを喰い止めることができるのか？
相田爱在老师的信赖下，成为了大贝第一中学学生会会长。在一次社会科的户外活动，她和同学来到地标建筑四叶塔（Clover Tower）参观，一路上忙着照顾众人。就在她终于可以停下来，期待展望台的景色时，巨大的怪物“自我中”突然出现，引起了庞大的混乱。不甘旁人被伤害的相田，遇上了扑克牌王国的精灵夏露露，倚靠不可思议的饰物能量，变身成为光之美少女－－心天使。随后其青梅竹马六花和小学玩伴有栖亦加入光之美少女的行列，誓要一同要把失去“爱”的怪物彻底净化。
故事发生在遥远的未来，彼时，人类早已经开始向月球移居，然而，移居到月球上的人类，和留在地球上的人类之间产生了无法调解的矛盾最终爆发了激烈的战争，最终，在月球上生活的人类同地球彻底划清了界限，建立的自己的国家，两颗星球之间完全属于断联的状态。
一晃眼几百年过去，月球和地球之间的关系好不容易得到了缓和，两者之间建立了“满弦崎中央联络港市”作为联络的渠道。朝雾达哉（千叶进步 配音）是一名平凡的青年，就读于满弦崎大学附属的卡特琳娜学院，达哉自幼失去了父亲，和姐姐沙也加（本山美奈 配音）、妹妹麻衣（安玖深音 配音）一起过着相依为命的生活。一天，沙也加告诉达哉，月球的公主要来地球拜访，而他们的家则成为了公主的暂住地。
一次车祸让远野志贵（铃村健一 配音）拥有了能够看到“死之线”的能力。死之线是一些遍布在各种物体上的线，只要沿着它切割，就能轻易的摧毁物体，这种能力让志贵苦恼不已。一日放学的途中，志贵遇见了一名白衣女子，体内突然产生的杀意让志贵措手不及，还未反应过来便将女子切成了碎片。第二天，本该死去的女子却站在志贵的面前，她告诉志贵，自己叫做艾尔奎特（生天目仁美 配音），是拥有不死之身的吸血鬼，一直追踪并企图消灭死徒罗阿（三宅健太 配音）。志贵的攻击让艾尔奎特的身体极度衰弱，因为，在恢复之前，志贵必须肩负起保护她安全的职责。
在目睹了罗阿的暴行之后，志贵决定加入消灭罗阿的队伍中去。同时，教会的雪露（折笠富美子 配音）也同罗阿有着难解之仇。在追踪罗阿的过程中，志贵渐渐发觉有一些非比寻常的记忆正在脑海中苏醒，一直坚信着的自己的过去，竟然是一个骗局。
