半空之中，漂浮着闪烁着多彩光芒的“知识之箱”，那里面藏着数不尽的世界、时间和人类。杜娅尔（种田梨沙 配音）与多萝茜（佐仓绫音 配音）穿梭于“知识之箱”之中，与侵蚀各个世界的病毒作战。凡是被病毒污染的世界，必须尽快予以消除。某天，两人感觉到新病毒的出现，她们赶了过去，结果发现遭到病毒袭击的少女莉莫（花守由美里 配音）。少女失去了记忆，只知晓性命，她说出的第一句话关系着所有人的命运……
2017年7月14日起，在YouTube的“KADOKAWAanime频道”上架AT-X和网络电视光TV于每集正篇播完之后追加的短篇动画《咕噜咕噜魔法阵 小剧场 冒险之书（グルグルぷちあにめ劇場 ぼうけんのしょ）》（仅在上架后的两周内公开），内容为补充正篇删除的部分内容。
実地研修（スタジエール）を見事突破した創真たちが、温泉旅館で休息を満喫！？ 極星寮のメンバーをはじめ、タクミやイサミ、郁魅も登場！ 普段は見ることができない、創真たちの休日を描いたアニメオリジナルストーリー！
捆绑漫画单行本第24卷限定版动画，绘里奈CV由于种田梨沙病休而由金元寿子替代。
少女成濑顺（水濑祈 配音）有着一段不堪回首的童年往事，曾经，年少无知的她因为口无遮拦，导致了家族的悲剧，而她本人亦被封印了言语，无法再开口说话。这样的顺终日生活在悲伤之中，和所有人都保持着距离，紧紧的关闭上了心门。
某一天，浑浑噩噩迷迷糊糊的少年坂上拓実（内山昂辉 配音）、因为受伤而无法完成棒球梦想的田崎大树（细谷佳正 配音）、深陷令人苦恼的恋爱之中的拉拉队员仁藤菜月（雨宫天 配音）以及顺，这四人被老师任命组成了“地域沟通交流会”，他们要在交流会上表演一出音乐剧，可是班级里的大部分学生对此兴趣寥寥。在一片争执声中，顺突然出声，担下了演唱的任务。
