以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地一对小兄妹的介绍下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭遇了极其危险的情况。关键时刻，掌管时间的迪亚鲁加和守卫神殿的西娜（北乃きい 配音）、凯宾（岸祐二 配音）帮助了他们，能与神奇宝贝心灵沟通的西娜还熄灭了冥王龙的怒火。从西娜口中得知，创造了世界的神奇宝贝即将苏醒，它不仅会使时空扭曲错乱，还将为世界带来毁灭性的灾难…… 本片为神奇宝贝系列第十二部电影剧场版。
【OVA内容简介】
梦见成为Prima的灯里，开始对自己早已熟悉了的日常风景开始感到困惑不安。即使梦醒之后这种不安仍然没有消除，灯里的脑子里慢慢出现了这样一个疑问：“为什么艾莉西亚会选择自己（进AIRA COMPANY）呢？”为了解答灯里梦中的疑问，艾莉西亚开始讲述自己的过去。慢慢的，灯里入社、AIRA公司的过往历史被一页页翻开。从创建AIRA的全能领航员奶奶开始，AIRA公司代代传承的东西和思想到底是什么呢？
【剧情介绍】
公元2301年，随着未来科技的发展，一颗荒芜的行星被人们改造成碧波荡漾的“水星”，人们把它叫做“AQUA”。“AQUA”里最著名的观光都市“新威尼斯”，有着一群心怀梦想的美丽少女。在这个日渐繁华的旅游都市里，随着源源不断而来的移民，由女性组成的导游职业，就显得尤为亲切，人们把那些少女们称作 “水星领航员”，她们划着小船，带领游客...
这是以公元1969年(昭和44年)高度发展期间的日本为舞台的故事，高度的经济发展为日本带来了无限的展望，但谜の侵略者(インベーダー invader)却在背地里进行着破坏，为了对抗invader人类成立了地球防卫机构A.E.G.I.S. (Alien Exterminating Global Intercept System)，而具有打开异世界之门并用门之力与invader战斗的人们便被称为GATE KEEPERS(捍卫者)。
主要人物介绍
浮矢瞬 SHUN UKIYA (CV:樱井孝宏)
昭和27年出生 17岁 盾神高校2年级 身高168cm 血型O #124;京都出身
能控制大气流动的「疾风之门」。特技是将空气压缩后再放出的用于中远距离攻击的「真空导弹」以及利用AEGIS的特制木刀发出的「ウルトラ旋风斩り」。家中有母亲和妹妹两人，父亲在他小学毕业...
在古老的传说中，长有洁白羽翼的公主被禁锢在房间之中，希冀这外面的世界。某日，一位神秘的少年出现在了公主的面前，成为了公主唯一的朋友。透过少年之口，公主得以知道大千世界里发生的种种。然而，当公主和少年相爱之时，曾经的诅咒应验了。
神尾观铃（川上伦子 配音）自小体弱多病，孱弱的身体令她无法去学校上课，只能整日待在家中。然而，观铃却并没有因此而变得郁郁寡欢，因为她相信，自己总有一天会遇见传说中的那个少年。国崎往人（小野大辅 配音）是一位旅行中的人偶师，他一直在寻找母亲所告诉他的“在空中的少女”。当往人遇见观铃之时，他发现，也许观铃正是他想要寻找的那个人。
