六、七十年代的香港，警察贪污，黑道横行，正是陈华（刘青云饰）与喇叭（林家楝饰）、猫仔（张晋饰）及一班兄弟最风光的日子。
陈华被视为「慈云山十三太保」之首，气焰高涨；还结识了一生至爱可柔（江一燕饰），共度人生最甜蜜的时光。可惜好景不常，陈华因私下贩毒而被帮会追杀，幸好在亦敌亦友的扫毒组组长哈雷（古天乐饰）帮助下，逃出生天，但却终究法网难逃。出狱后，遭逢父亲病逝及女友可柔失踪，无比自责的陈华，顿然觉悟前非，立志重新做人。他不但积极参与青少年戒毒工作，获得十大杰青荣誉；更把喇叭与猫仔拉回正途，又经常出手调停江湖纠纷，因而深受黑白两道所敬重。某次于日本出席戒毒讲座后，陈华与可柔在街头重遇。他一心再续前缘，但又能否轻易为自己的感情拆弹？
「希腊神话有一个传说，人类原本是男女同体，两个头，四只手，四只脚…然而天神宙斯妒忌人类太幸福，于是用雷电劈开男和女，命运女神把本来一对对的男女分散各地，令他们忘记对方。但是人类的心灵仍然保留了另一半的感觉，于是人类就凭着这丝感觉在人世间寻找另一半…」
叶香香 (林熹瞳 饰) 的女儿叶家家 (汤怡 饰) 希望从明信中学里的华丽而又神秘之图书馆内，寻找亲生母亲生前的足迹；就在一次反对大集团拆迁此极具历史文物价值的图书馆大楼的抗争活动中，家家竟遇上了古华生 (林文龙 饰) 的爱徒陈家强 (谭耀文 饰) ；一连串凄美残酷的真相均偶发在这图书馆大楼内。家家揭发了自己的养母 (张文慈 饰) 竟是害死母亲爱人古华生的主要帮凶！爱恨交纒，一触即发。
飞虎队员阿坚在警方的安排下，成功打入黑社会内部，做起了卧底，黑社会老大肥叔始终怀疑阿坚的身份，屡屡找各个机会来试探阿坚，但阿坚都化险为夷，香港黑社会四大家族火拼九龙湾，一场混战中，阿坚救了肥叔一命，从此，肥叔相信了阿坚。
肥叔计划抢劫金铺失败，肥叔把气发在上次追杀他的黑社会四大家族之一的匡仔身上，准备报复匡仔。为了避免更大规模的流血事件发生，阿坚又将消息传回警局，但还是晚了一步，肥叔的儿子偶遇阿娇，他不知是阿坚的妹妹，阿娇被其强暴，并拍下录像，阿坚不顾队长的劝阻，杀了肥叔的儿子，但不幸暴露了身份。
肥叔抓不到阿坚，一怒之下，杀了阿坚的全家，阿坚终于现身，设计绑架肥叔，阿坚这一行动引来了警方和肥
叔的马仔，黑白两道在九龙湾相遇...
蜀山群山之中的昆仑山，掌门孤月大师（张柏芝饰）与徒弟玄天宗（郑伊健饰）相恋，事先预感邪恶的幽泉血魔会进攻昆仑，自知无力抵抗的她，为保天宗性命而借故赶他下山，并将昆仑秘藏武器“日月金轮”交付天宗，而自己则为血魔所杀，昆仑山灵气尽被吸去。
二百年后，邪恶力量再次侵犯正派，峨嵋开山祖师峨嵋真人（洪金宝饰），惟恐此战伤及凡间，乃派大弟子丹辰子（古天乐饰）前往山下疏离凡间正在交战的军队，在途中与程乐天（章子怡饰）、玄天宗相遇，却意外发现血魔的秘密，并因而落入陷阱。在生死之际峨嵋真人率弟子前来救援，玄天宗赫然发现其中一名女弟子李英奇（张柏芝饰），样子竟酷似师傅孤月大师。同时，峨嵋真人发觉中了血魔诡计，一场更为凶险的正邪大战即将展开……
